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Registros recuperados : 54 | |
5. | | FEDERICI, M.; SCHCHERBAN, A.; CAPDEVIELLE, F.; FRANCIS, M.; VAUGHAN, D. Analysis of genetic diversity in the Oryza officinalis complex. [Research article]. Electronic Journal of Biotechnology, 15 August 2002, Volume 5, Issue 2, Pages 85-94. OPEN ACCESS. Article history: Received February 12, 2002 / Accepted August 7, 2002 / Published: 15 August, 2002.
Financial support: Japan Cooperation Agency ? individual training of Group Course ?Plant Genetic Resources?.Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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6. | | FEDERICI, M.; SHCHERBAN, A.; CAPDEVIELLE, F.; FRANCIS, M.; VAUGHAN, D. Analysis of genetic diversity in the Oryza officinalis complex. [Resumen]. ln: Conferencia Internacional de Arroz de Clima Templado, 3., 2003, Punta del Este, Uruguay Resúmenes. Montevideo (Uruguay): ACA; INIA; GMA; FLAR, 2003. p. 40 "Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Uruguay (INIA); Asociación de Cultivadores de Arroz (ACA); Gremial de Molinos Arroceros (GMA); Fondo Latinoamericano de Arroz de Riego (FLAR)"Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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9. | | CAPDEVIELLE, F.; FEDERICI, M.; SALDAIN, N.E.; VAUGHAN, D. Differentiation of uruguayan weedy rice and cultivars using marker-assisted classification. [Resumen]. ln: Conferencia Internacional de Arroz de Clima Templado, 3., 2003, Punta del Este, Uruguay Resúmenes. Montevideo (Uruguay): ACA; INIA; GMA; FLAR, 2003. p. 41 "Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Uruguay (INIA); Asociación de Cultivadores de Arroz (ACA); Gremial de Molinos Arroceros (GMA); Fondo Latinoamericano de Arroz de Riego (FLAR)"Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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11. | | FEDERICI, M.; BRANDA, A.; ARTIGAS, R.; DUTRA, F.; LLAMBÍ, S. High- resolution melting (HRM) curve analysis: New approach used to detect blad and dumps in Uruguayan Holstein breed. [Análise da curva de alta resolucao (HRM): Nova abordagem usada para detectar blad e dumps em bovinos da raça Holandesa Uruguaia]. Archives of Veterinary Science, 2018, volume 23, Issue 4, pages 1-9. OPEN ACCESS. Article history: Received 29 October 2018 // Accepted 29 November 2018.
This research was supported by the Unit of Biotechnology of INIA Las Brujas. We thank Dr. Marco Dalla Rizza, coordinator of the Unit of Biotechnology, as well as the...Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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12. | | CAPDEVIELLE, F.; FEDERICI, M.; SOLARES, E.; BRANDA, A.; ÁVILA, S. Molecular strategies for characterization of fungal isolates from uruguayan rice fields. [Resumen]. ln: Conferencia Internacional de Arroz de Clima Templado, 3., 2003, Punta del Este, Uruguay Resúmenes. Montevideo (Uruguay): ACA; INIA; GMA; FLAR, 2003. p. 79 "Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria, Uruguay (INIA); Asociación de Cultivadores de Arroz (ACA); Gremial de Molinos Arroceros (GMA); Fondo Latinoamericano de Arroz de Riego (FLAR)"Biblioteca(s): INIA Treinta y Tres. |
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16. | | MAESO, D.; FEDERICI, M.; MARTINEZ, A.; SILVERA, M.; GONCALVEZ, L. Studies on pear decline disease in Uruguay. [abstract of poster]. In: Zoppolo, R. Cabrera, D. (Eds.). Growing in diversity. Proceedings of the International Pear Symposium, 13, Dec. 4-7th 2018, Montevideo, Uruguay. p. 166.Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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17. | | MAESO, D.; FEDERICI, M.; MARTÍNEZ, A.; SILVERA, M.; GONCALVEZ, L. Studies on pear decline disease in Uruguay. [Conference paper]. Acta Horticulturae, February 2021, N°1303, p. 343-350. DOI: https://doi.org/10.17660/ActaHortic.2021.1303.48 Article history: Published 5 February 2021. In: Acta Horticulturae (ISHS) 1303: XIII International Pear Symposium, Montevideo, Uruguay. Conveners: Roberto Zoppolo, Danilo Cabrera. Editors: Roberto Zoppolo, Danilo Cabrera, D. Granatstein.Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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18. | | FEDERICI, M.T.; RIVAS, F.; GIANNONE, N.; ZERBINO, M.S.; DALLA RIZZA, M. Análisis de la diversidad de bacterias en rizósfera de maíz transgénico con potencial aplicación en estudios de bioseguridad. In: BRAZILIAN BIOSAFETY CONGRESS, 8.; EXHIBITION ON BIOSAFETY?S EQUIPAMENT AND DEVICES, 8.; WORKSHOP DEFINING BIOSECURITY STRATEGIES IN THE MANAGEMENT AT BIG MEETINGS, 2013, Salvador, Bahia, BR. Building capacities on biosafety within the bioeconomy context: resumo. Rio de Janeiro: ANBio, 2013Biblioteca(s): INIA La Estanzuela. |
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19. | | FEDERICI, M.; BAJSA, N.; LAGURARA, P.; REVALE, S.; LEONI, C.; MARCONDES, J.; DALLA RIZZA, M. Analysis of bacterial diversity in maize rhizosphere and bulk, soil using DGGE and 454-Pyrosequencing of the 165 RRNA gene. GGM 46 - COMUNICACIONES LIBRES - GGM. GENÓMICA Y GENÉTICA MOLECULAR In: JOURNAL OF BASIC & APPLIED GENETICS, 2016, Vol.27, Iss. 1 (Supp.). XVI LATIN AMERICAN CONGRESS OF GENETICS, IV CONGRESS OF THE URUGUAYAN SOCIETY OF GENETICS, XLIX ANNUAL MEETING OF THE GENETICS SOCIETY OF CHILE, XLV ARGENTINE CONGRESS OF GENETICS, 9-12 October 2016. PROCEEDINGS. Montevideo (Uruguay): SAG, 2016. p. 277Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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20. | | BRANDA, A.; FEDERICI, M.; BRIANO, C.; ROMERO, A.; LLAMBÍ, S.; DUTRA, F.; DALLA RIZZA, M. Avances en la identificación de portadores de la deficiencia en la adhesión leucocitaria bovina en raza Holando. In: JORNADA TÉCNICA, VIII JORNADA DE AGROBIOTECNOLOGÍA. INIA LAS BRUJAS, 30 DE OCTUBRE DE 2014. UNIDAD DE BIOTECNOLOGÍA. Montevideo (Uruguay): INIA, 2014. 7-9 (Actividades de Difusión; 741)Biblioteca(s): INIA Las Brujas. |
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Registros recuperados : 54 | |
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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha actual : |
13/03/2020 |
Actualizado : |
13/03/2020 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Circulación / Nivel : |
Internacional - -- |
Autor : |
BRANDA, A.; NICOLINI, P.; FEDERICI, M.; LLAMBÍ, S. |
Afiliación : |
ANDREA BRANDA SICA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PAULA NICOLINI, Universidad de La República, Centro Universitario de Tacuarembó, Instituto Superior de la Carne, Área Biología Molecular; MARIA TERESA FEDERICI RODRIGUEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVIA LLAMBÍ, Universidad de La República. Facultad de Veterinaria, Sección Genética. |
Título : |
Identification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.] |
Fecha de publicación : |
2019 |
Fuente / Imprenta : |
Archives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494 |
ISSN : |
1517-784X |
DOI : |
10.5380/avs.v24i4.65494 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019.
Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy |
Contenido : |
ABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agropecuária de Uruguai. A otimização da metodologia HRM no equipamento RotorGene?6000 (Corbett Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T) para CVM na amostra analisada foi alta, de q= 0,032, enquanto que a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão para a detecção dessa mutação no gado Holandês, que poderia ser implementada em programas de seleção genética. MenosABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agr... Presentar Todo |
Palabras claves : |
Curvas de dissociaçãode alta resolução; CVM; High-resolution dissociation curve. |
Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/14303/1/Branda-A.-2019.-Archives-of-Veterinary-Science.pdf
https://revistas.ufpr.br/veterinary/article/download/65494/40219
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Marc : |
LEADER 03306naa a2200229 a 4500 001 1060918 005 2020-03-13 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1517-784X 024 7 $a10.5380/avs.v24i4.65494$2DOI 100 1 $aBRANDA, A. 245 $aIdentification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.]$h[electronic resource] 260 $c2019 500 $aArticle history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019. Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy 520 $aABSTRACT. The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs. RESUMO. O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agropecuária de Uruguai. A otimização da metodologia HRM no equipamento RotorGene?6000 (Corbett Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T) para CVM na amostra analisada foi alta, de q= 0,032, enquanto que a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão para a detecção dessa mutação no gado Holandês, que poderia ser implementada em programas de seleção genética. 653 $aCurvas de dissociaçãode alta resolução 653 $aCVM 653 $aHigh-resolution dissociation curve 700 1 $aNICOLINI, P. 700 1 $aFEDERICI, M. 700 1 $aLLAMBÍ, S. 773 $tArchives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494
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